- s -

• saveImage() : Avogadro::PlotWidget
• scale() : Avogadro::Camera
• scaleLimits() : Avogadro::PlotWidget
• scalingCoefficient() : Avogadro::Camera
• scmRevision() : Avogadro::Library
• secondaryDataRect() : Avogadro::PlotWidget
• secondaryStructure() : Avogadro::Protein
• selectedPrimitives() : Avogadro::GLWidget
• selectPoint() : Avogadro::PlotWidget
• selectPoints() : Avogadro::PlotWidget
• set() : Avogadro::Color3f
• setAbsoluteFilePath() : Avogadro::PluginItem
• setActiveTool() : Avogadro::ToolGroup
• setAlias() : Avogadro::Engine
• setAllConformers() : Avogadro::Molecule
• setAlpha() : Avogadro::Color
• setAngleOfViewY() : Avogadro::Camera
• setAntialiasing() : Avogadro::PlotWidget
• setAromaticity() : Avogadro::Bond
• setAtomicNumber() : Avogadro::Atom
• setAtomId() : Avogadro::Residue
• setAtomIds() : Avogadro::Residue
• setAtomPos() : Avogadro::Molecule
• setAtoms() : Avogadro::Bond
• setBackground() : Avogadro::GLWidget
• setBackgroundColor() : Avogadro::PlotWidget
• setBarBrush() : Avogadro::PlotObject
• setBarPen() : Avogadro::PlotObject
• setBarWidth() : Avogadro::PlotPoint
• setBegin() : Avogadro::Bond
• setBond() : Avogadro::ZMatrix
• setBottomPadding() : Avogadro::PlotWidget
• setBrush() : Avogadro::PlotObject
• setChainID() : Avogadro::Residue
• setChainNumber() : Avogadro::Residue
• setColor() : Avogadro::ColorButton , Avogadro::GLPainter , Avogadro::Painter
• setColorMap() : Avogadro::Engine , Avogadro::GLWidget
• setColors() : Avogadro::Mesh
• setConformer() : Avogadro::Molecule
• setCube() : Avogadro::Mesh
• setCurrent() : Avogadro::GLWidget
• setCustomColorName() : Avogadro::Atom
• setCustomData() : Avogadro::PlotPoint
• setCustomLabel() : Avogadro::Atom , Avogadro::Bond
• setCustomRadius() : Avogadro::Atom
• setData() : Avogadro::Cube
• setDefaultLimits() : Avogadro::PlotWidget
• setDefaultPaddings() : Avogadro::PlotWidget
• setDescription() : Avogadro::Engine , Avogadro::PluginItem
• setDialogTitle() : Avogadro::ColorButton
• setDipoleMoment() : Avogadro::Molecule
• setDynamicBonds() : Avogadro::Animation
• setDynamicScaling() : Avogadro::GLPainter
• setEnabled() : Avogadro::Engine , Avogadro::PluginItem
• setEnd() : Avogadro::Bond
• setEnergies() : Avogadro::Molecule
• setEnergy() : Avogadro::Molecule
• setExtensions() : Avogadro::GLWidget
• setFileName() : Avogadro::Molecule , Avogadro::PluginItem
• setFogLevel() : Avogadro::GLWidget
• setFont() : Avogadro::PlotWidget
• setFontSize() : Avogadro::PlotWidget
• setForceVector() : Avogadro::Atom
• setForegroundColor() : Avogadro::PlotWidget
• setFormalCharge() : Avogadro::Atom
• setFps() : Avogadro::Animation
• setFrame() : Avogadro::Animation
• setFrames() : Avogadro::Animation
• setFromGradient() : Avogadro::Color
• setFromIndex() : Avogadro::Color
• setFromPrimitive() : Avogadro::Color
• setFromQColor() : Avogadro::Color
• setFromRgba() : Avogadro::Color
• setGridColor() : Avogadro::PlotWidget
• setGroupIndex() : Avogadro::Atom
• setId() : Avogadro::Primitive
• setIdentifier() : Avogadro::PluginItem
• setIndex() : Avogadro::Primitive
• setIsoValue() : Avogadro::Mesh
• setJailedInDefaults() : Avogadro::PlotWidget
• setLabel() : Avogadro::PlotAxis , Avogadro::PlotPoint
• setLabelPen() : Avogadro::PlotObject
• setLeftPadding() : Avogadro::PlotWidget
• setLimits() : Avogadro::Cube , Avogadro::PlotWidget
• setLinePen() : Avogadro::PlotObject
• setListening() : Avogadro::PythonError
• setLoopCount() : Avogadro::Animation
• setMatrix() : Avogadro::TextMatrixEditor
• setMaxZ() : Avogadro::GLHit
• setMinZ() : Avogadro::GLHit
• setModelview() : Avogadro::Camera
• setMolecule() : Avogadro::ToolGroup , Avogadro::Extension , Avogadro::Animation , Avogadro::Engine , Avogadro::GLWidget , Avogadro::PythonInterpreter , Avogadro::Tool
• setName() : Avogadro::GLPainter , Avogadro::Mesh , Avogadro::Painter , Avogadro::PluginItem , Avogadro::GLPainter , Avogadro::Color , Avogadro::Fragment , Avogadro::GLHit
• setNormals() : Avogadro::Mesh
• setNumber() : Avogadro::Residue
• setOBAtom() : Avogadro::Atom
• setOBBond() : Avogadro::Bond
• setObjectToolTipShown() : Avogadro::PlotWidget
• setOBMol() : Avogadro::Molecule
• setOBUnitCell() : Avogadro::Molecule
• setOrder() : Avogadro::Bond
• setOtherMesh() : Avogadro::Mesh
• setPainterDevice() : Avogadro::Engine
• setParent() : Avogadro::Camera
• setPartialCharge() : Avogadro::Atom
• setPen() : Avogadro::PlotObject
• setPixRect() : Avogadro::PlotWidget
• setPluginPath() : Avogadro::PluginManager
• setPointFollowMouse() : Avogadro::PlotWidget
• setPointStyle() : Avogadro::PlotObject
• setPos() : Avogadro::Atom
• setPosition() : Avogadro::PlotPoint
• setPrimitives() : Avogadro::Engine
• setProjection() : Avogadro::GLWidget
• setQuality() : Avogadro::GLPainter , Avogadro::GLWidget
• setQuickRender() : Avogadro::GLWidget
• setRenderAxes() : Avogadro::GLWidget
• setRenderDebug() : Avogadro::GLWidget
• setRenderUnitCellAxes() : Avogadro::GLWidget
• setResidue() : Avogadro::Atom
• setRightPadding() : Avogadro::PlotWidget
• setSecondaryLimits() : Avogadro::PlotWidget
• setSelected() : Avogadro::GLWidget
• setShader() : Avogadro::Engine
• setShowBars() : Avogadro::PlotObject
• setShowGrid() : Avogadro::PlotWidget
• setShowLines() : Avogadro::PlotObject
• setShowPoints() : Avogadro::PlotObject
• setSize() : Avogadro::PlotObject
• setStable() : Avogadro::Mesh
• setTickLabelFormat() : Avogadro::PlotAxis
• setTickLabelsShown() : Avogadro::PlotAxis
• setTickMarks() : Avogadro::PlotAxis
• settingsTitle() : Avogadro::Tool , Avogadro::PythonTool
• settingsWidget() : Avogadro::Tool , Avogadro::Plugin , Avogadro::PythonTool , Avogadro::PythonEngine , Avogadro::Engine
• setTool() : Avogadro::GLWidget
• setToolGroup() : Avogadro::GLWidget
• setTopPadding() : Avogadro::PlotWidget
• setToSelectionColor() : Avogadro::Color
• setType() : Avogadro::PluginItem , Avogadro::GLHit
• setUndoStack() : Avogadro::GLWidget
• setUnitCellColor() : Avogadro::GLWidget
• setUnitCells() : Avogadro::GLWidget
• setup() : Avogadro::Sphere , Avogadro::Cylinder
• setValue() : Avogadro::Cube
• setVertices() : Avogadro::Mesh
• setVisible() : Avogadro::PlotAxis
• setX() : Avogadro::PlotPoint
• setY() : Avogadro::PlotPoint
• shader() : Avogadro::Engine
• shape() : Avogadro::ElementDetail , Avogadro::ElementItem
• size() : Avogadro::IDList , Avogadro::PrimitiveList , Avogadro::PlotObject
• sizeHint() : Avogadro::GLWidget , Avogadro::PlotWidget
• spacing() : Avogadro::Cube
• stable() : Avogadro::Mesh
• start() : Avogadro::Animation
• stop() : Avogadro::Animation
• string() : Avogadro::PythonError
• subList() : Avogadro::IDList , Avogadro::PrimitiveList